Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01655 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01655 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01655 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01655 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01655 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01655 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01655 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01655 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01655 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01655 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01655 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01655 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01655 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01655 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01655 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01655 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01655 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms