Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB6O95452 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB6O95452 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB6O95452 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB6O95452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB6O95452 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB6O95452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB6O95452 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB6O95452 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB6O95452 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB6O95452 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB6O95452 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB6O95452 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB6O95452 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB6O95452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB6O95452 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB6O95452 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB6O95452 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB6O95452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB6O95452 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB6O95452 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB6O95452 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB6O95452 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB6O95452 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB6O95452 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB6O95452 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB6O95452 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB6O95452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB6O95452 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB6O95452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB6O95452 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB6O95452 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB6O95452 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB6O95452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB6O95452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB6O95452 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms