Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5LO95447 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5LO95447 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms