Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setdb1O88974 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setdb1O88974 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setdb1O88974 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms