Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BlmO88700 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BlmO88700 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
BlmO88700 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BlmO88700 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BlmO88700 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BlmO88700 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BlmO88700 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BlmO88700 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BlmO88700 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
BlmO88700 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BlmO88700 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BlmO88700 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BlmO88700 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BlmO88700 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BlmO88700 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
BlmO88700 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BlmO88700 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
BlmO88700 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BlmO88700 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BlmO88700 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BlmO88700 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BlmO88700 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BlmO88700 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BlmO88700 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
BlmO88700 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BlmO88700 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
BlmO88700 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BlmO88700 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BlmO88700 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
BlmO88700 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BlmO88700 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BlmO88700 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BlmO88700 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BlmO88700 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BlmO88700 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BlmO88700 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BlmO88700 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BlmO88700 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BlmO88700 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BlmO88700 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BlmO88700 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BlmO88700 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BlmO88700 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BlmO88700 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BlmO88700 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BlmO88700 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BlmO88700 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BlmO88700 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BlmO88700 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BlmO88700 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BlmO88700 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BlmO88700 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BlmO88700 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BlmO88700 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BlmO88700 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BlmO88700 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BlmO88700 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BlmO88700 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BlmO88700 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BlmO88700 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BlmO88700 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BlmO88700 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BlmO88700 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BlmO88700 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BlmO88700 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms