Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIN3BO75182 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIN3BO75182 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms