Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra6O70491 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stra6O70491 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra6O70491 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stra6O70491 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stra6O70491 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms