Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3dO70194 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3dO70194 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3dO70194 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eif3dO70194 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3dO70194 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3dO70194 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3dO70194 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms