Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRD4O60885 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BRD4O60885 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BRD4O60885 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
BRD4O60885 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BRD4O60885 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD4O60885 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRD4O60885 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD4O60885 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
BRD4O60885 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRD4O60885 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRD4O60885 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD4O60885 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRD4O60885 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
BRD4O60885 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRD4O60885 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRD4O60885 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRD4O60885 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
BRD4O60885 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRD4O60885 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD4O60885 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD4O60885 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD4O60885 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD4O60885 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD4O60885 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD4O60885 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRD4O60885 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD4O60885 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD4O60885 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD4O60885 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD4O60885 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRD4O60885 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRD4O60885 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
BRD4O60885 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRD4O60885 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRD4O60885 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRD4O60885 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD4O60885 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD4O60885 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD4O60885 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD4O60885 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD4O60885 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD4O60885 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD4O60885 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD4O60885 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRD4O60885 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRD4O60885 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRD4O60885 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms