Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pja1O55176 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pja1O55176 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pja1O55176 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja1O55176 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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