Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dsg2O55111 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dsg2O55111 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms