Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f6O54917 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f6O54917 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f6O54917 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms