Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITM2AO43736 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms