Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASA4O43374 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASA4O43374 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASA4O43374 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASA4O43374 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASA4O43374 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASA4O43374 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASA4O43374 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RASA4O43374 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RASA4O43374 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASA4O43374 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASA4O43374 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASA4O43374 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASA4O43374 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASA4O43374 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASA4O43374 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RASA4O43374 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASA4O43374 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RASA4O43374 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RASA4O43374 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms