Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f3O35261 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2f3O35261 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f3O35261 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f3O35261 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f3O35261 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f3O35261 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f3O35261 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms