Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A2O14975 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A2O14975 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A2O14975 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A2O14975 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A2O14975 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A2O14975 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A2O14975 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A2O14975 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A2O14975 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A2O14975 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A2O14975 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A2O14975 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC27A2O14975 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A2O14975 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms