Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vwa3bJ9JI28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vwa3bJ9JI28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vwa3bJ9JI28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms