Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Ccdc180J3QNE4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc180J3QNE4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc180J3QNE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc180J3QNE4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Ccdc180J3QNE4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccdc180J3QNE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms