Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lipo1J3QME6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lipo1J3QME6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lipo1J3QME6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms