Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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Gm20828J3KMI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20828J3KMI7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Gm20828J3KMI7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Gm20828J3KMI7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20828J3KMI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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