Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pabpc4lG5E8X2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms