Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arfgef1G3X9K3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arfgef1G3X9K3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Arfgef1G3X9K3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms