Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610008E11RikG3X964 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610008E11RikG3X964 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.7 ms