Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmigd3G3X8R9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmigd3G3X8R9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmigd3G3X8R9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmigd3G3X8R9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms