Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r167G3UW71 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r167G3UW71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r167G3UW71 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms