Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpcdF8VQB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NpcdF8VQB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NpcdF8VQB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NpcdF8VQB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms