Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colca2F8VPY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colca2F8VPY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colca2F8VPY8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms