Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm15056F6ZR08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm15056F6ZR08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm15056F6ZR08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm15056F6ZR08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm15056F6ZR08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm15056F6ZR08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm15056F6ZR08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm15056F6ZR08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm15056F6ZR08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm15056F6ZR08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms