Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf212F6TQD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms