Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227AF5H4B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM227AF5H4B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227AF5H4B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms