Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh18E9Q9Q6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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