Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
6030445D17RikE9Q8F9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
6030445D17RikE9Q8F9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
6030445D17RikE9Q8F9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms