Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfr2E9Q5M4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfr2E9Q5M4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfr2E9Q5M4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms