Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms