Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30bE9PVL6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30bE9PVL6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30bE9PVL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms