Protein–RNA interactions for Protein: E9PUB3

Gm5878, Predicted gene 5878, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5878E9PUB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5878E9PUB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5878E9PUB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms