Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PROB1E7EW31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms