Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc78D3Z5T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms