Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NT5C1B-RDH14C9J2C7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NT5C1B-RDH14C9J2C7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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