Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm6133B2RY53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6133B2RY53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6133B2RY53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms