Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn7aB1AYL1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn7aB1AYL1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scn7aB1AYL1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms