Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nfx1B1AY10 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfx1B1AY10 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfx1B1AY10 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms