Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Herc3A6H6S0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herc3A6H6S0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms