Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prdm2A2A7B5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm2A2A7B5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm2A2A7B5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm2A2A7B5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1040.1 ms