Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM223A0PJW6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.9 ms