Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cc2d2bA0A286YDU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cc2d2bA0A286YDU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cc2d2bA0A286YDU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms