Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700028J19RikA0A0U1RP08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms