Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn2aA0A0J9YTW6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms