Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb6Q9Z0T9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb6Q9Z0T9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms