Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYVE1Q9Y5Y7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms